Skip to content

๐Ÿ”จFeatures

Genomic ranges operations

Features Bioframe polars-bio PyRanges Pybedtools PyGenomics GenomicRanges
overlap โœ… โœ… โœ… โœ… โœ… โœ…
nearest โœ… โœ… โœ…
cluster โœ…
merge โœ…
complement โœ…
select/slice โœ…
coverage โœ…
expand โœ…
sort โœ…

Input/Output

I/O Bioframe polars-bio PyRanges Pybedtools PyGenomics GenomicRanges
Pandas DataFrame โœ… โœ… โœ…
Polars DataFrame โœ…
Polars LazyFrame โœ…
Native readers โœ